A Nova Era da Microbiologia - módulo III (Metagenômica)
O curso “A Nova Era da Microbiologia - Módulo III (Metagenômica)" tem como objetivo apresentar aos alunos o conceito de metagenômica, a composição da microbiota humana e ambiental, bem como principais estratégias experimentais para identificação de micro-organismos não cultiváveis por sequenciamento de nova...
CERTIFICADO 30 hs
Mais info: nacientifico.com.br/course/metagenomica/
UNIDADE 1 – Definições, componentes do microbioma, fatores que o influenciam e seu papel.
Microbiota
Microbioma
One health
Conceito de separação (simbiontes, comensais, patobiontes, oportunistas)
Hologenome theory of evolution
Interação Microbiomas (Humano x animal x ambiental x químico x alimentar)
Metagenôma
Microbioma
Workflow das técnicas
Vantagens da metagenômica
Distribuição bacteriana no organismo
Genomas não classificados
Fungos
Relações entre microorganismos
Impacto das infecções
Microbiota Comensal
Viroma humano
Influência de fatores externos
Papel da microbiota
Metabólitos bacterianos clinicamente relevantes
Efeitos locais
Equilíbrio da microbiota
Mais…
UNIDADE 2 – Introdução à metagenômica I – abordagens experimentais
Como estudar metagenômica
Impacto da tecnologia nas publicações
Métodos de extração de DNA
Tipos de extração x aplicações (RNA, DNA, etc)
16S (rRNA): bactérias
Primers
ITS: Fungos
Workflow do sequenciamento
Tipos de sequenciamento
Marcador alvo
Shotgun
metatranscriptoma
culturomics
Doenças infecciosas
UNIDADE 3 – Introdução à metagenômica II – controle de qualidade e principais ferramentas para análise.
Processamento de amplicons
Impacto do denoise na classificação
Clusterização
OTU – Unidade taxonômica operacional
ASV//ESV (Amplicon sequence variant / exact sequence variant)
Anotação das OTUs/ ASVs (Nomenclatura e classificação)
Banco de dados (16S/its)
Input/Output
Curva de rarefação/saturação
Diversidade alfa
Diversidade beta
Composição taxonômica
Análise comparativa diferencial
Análise correlação
Metagenome-assembled genomes (MAGs)
Profundidade do...
Conteúdo Vantagens Detalhes
- Definições, componentes do microbioma, fatores que o influenciam e seu papel
- Abordagens experimentais (16S rRNA, metagenoma, metatranscriptoma e culturomics)
- Controle de qualidade e principais ferramentas para análise
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Perguntas Frequentes
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